乌斯季尔特保护区内栖息着数十种哺乳动物和鸟类，其中包括乌斯季尔特盘羊、鹅喉羚、高鼻羚羊、狞猫、兔狲、沙猫、虎鼬、蜜獾、沙狐和狐狸。此外，保护区内还可见狼和胡狼。
珍稀鸟类包括金雕、草原雕、猎隼、游隼、秃鹫、短趾雕、雕鸮、火烈鸟和波斑鸨等。
为监测动物活动，保护区内专门安装了红外相机。这些自动相机无需人工操作，就能拍摄动物照片并记录视频。
专家通过获取的影像资料，研究动物的活动轨迹、行为习性、分布特点和生存环境。红外相机也为持续观察动物世界的状况提供了便利。
据保护区专家介绍，自动相机记录下的每一个画面，不仅展现了自然界中的一个个瞬间，也具有科研价值。收集到的相关资料将用于生物多样性监测和保护工作。
乌斯秋尔特国家自然保护区是哈萨克斯坦一处兼具自然保护与科学研究职能的国家级特别保护自然区域，其主要任务是保护、研究和恢复保护区内的自然过程与自然现象，以及各类野生动植物资源、动植物群落和具有代表性、独特性的生态系统。